Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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PTPRRQ15256 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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PTPRRQ15256 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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PTPRRQ15256 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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PTPRRQ15256 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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