Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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COL9A2Q14055 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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COL9A2Q14055 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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COL9A2Q14055 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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COL9A2Q14055 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL9A2Q14055 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL9A2Q14055 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL9A2Q14055 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL9A2Q14055 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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