Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PDE7AQ13946 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE7AQ13946 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms