Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms