Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms