Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms