Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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