Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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