Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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