Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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