Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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