Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD3Q12873 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD3Q12873 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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