Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms