Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTIFO43310 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CTIFO43310 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CTIFO43310 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CTIFO43310 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CTIFO43310 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTIFO43310 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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