Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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