Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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