Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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