Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms