Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RTL3Q8N8U3 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL3Q8N8U3 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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