Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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