Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms