Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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RPE65Q16518 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RPE65Q16518 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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