Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VAMP3Q15836 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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