Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EEA1Q15075 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EEA1Q15075 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms