Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.7 ms