Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MDC1Q14676 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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