Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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