Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX39BQ13838 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms