Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NAE1Q13564 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms