Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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