Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PICALMQ13492 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.7 ms