Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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