Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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TCOF1Q13428 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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TCOF1Q13428 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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TCOF1Q13428 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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TCOF1Q13428 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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TCOF1Q13428 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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TCOF1Q13428 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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