Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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