Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms