Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SP140Q13342 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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