Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms