Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF1Q12946 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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