Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIN2AQ12879 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms