Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms