Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRGP23470 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRGP23470 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRGP23470 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRGP23470 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRGP23470 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRGP23470 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRGP23470 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRGP23470 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms