Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRDP23468 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRDP23468 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRDP23468 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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