Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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