Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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LHX9Q9NQ69 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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LHX9Q9NQ69 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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LHX9Q9NQ69 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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