Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms