Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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