Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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