Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRAM2Q15035 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms