Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms