Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CDK13Q14004 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms